党政管理机构：

01：党政办公室（宣传部）

02：组织人事部（统战部）

03：教务部

04：科研规划部

05：学生工作部

06：财务部

07：保卫部

08：后勤管理部

09：纪检室

10：实习就业部

教学机构：

01：马克思主义学院

02：中医学院

03：南药学院

04：护理学院

05：临床医学院

06：医学技术学院

07：基础医学院

08：食品学院

09：继续教育学院

教学辅助机构：

01：信息中心

02：图书馆

03：附属门诊部

科研机构：

01：南药与食品研究院